કેનેડામાં ખાલિસ્તાન સમર્થકોની ભારત વિરોધી ગતિવિધિઓનો મુદ્દો પણ ટુ પ્લસ ટુ મંત્રી સ્તરની મંત્રણામાં સામે આવ્યો હતો. ભારતે અમેરિકા સમક્ષ પોતાની ચિંતા વ્યક્ત કરી હતી.
ખાલિસ્તાન સમર્થક હરદીપ સિંહ નિજ્જરની હત્યાને લઈને ભારત અને કેનેડા વચ્ચે વિવાદ ચાલુ છે. દરમિયાન ભારત અને અમેરિકા વચ્ચેની ટુ પ્લસ ટુ મંત્રી સ્તરની વાટાઘાટોમાં સરકારે કેનેડાને લઈને તેની ચિંતાઓ સ્પષ્ટ કરી હતી. ભારતે કહ્યું કે અમારી મુખ્ય ચિંતા સુરક્ષા છે. ટુ પ્લસ ટુ મંત્રી સ્તરીય વાટાઘાટો પછી વિદેશ સચિવ વિનય ક્વાત્રાએ કહ્યું, અમે અમારા બધા મિત્રો અને ભાગીદારો સાથે સતત સંવાદમાં છીએ. અમે અનેક પ્રસંગોએ આ બાબતે વિગતવાર અમારી સ્થિતિ સમજાવી છે. અમારી મુખ્ય ચિંતા સુરક્ષા છે. તમે તાજેતરમાં ગુરપતવંત સિંહ પન્નુનો વીડિયો જોયો જ હશે. આ ગંભીર સુરક્ષા ચિંતાઓ ઉભી કરે છે. અમે અમારા મિત્રો અને ભાગીદારોને અમારી સ્થિતિ સ્પષ્ટ કરી છે. અમને લાગે છે કે તેઓ તે સમજે છે.
શીખ ફોર જસ્ટિસ (SFJ)ના સંસ્થાપક ગુરપતવંત સિંહ પન્નુએ તાજેતરમાં એક વીડિયો જાહેર કર્યો હતો. આમાં તેણે ૧૯ નવેમ્બરે એર ઈન્ડિયાની ફ્લાઈટના મુસાફરોને ધમકી આપી છે, જે દિવસે આઈસીસી વર્લ્ડ કપની ફાઈનલ યોજાશે. ભારત સતત પન્નુ અને અન્ય ખાલિસ્તાન સમર્થકો સામે કાર્યવાહીની માંગ કરી રહ્યું છે. જોકે, કેનેડા દ્વારા નક્કર પગલાં ન લેવાને કારણે ભારત સરકારે અનેક વખત નારાજગી વ્યક્ત કરી છે. દિલ્હીમાં યોજાયેલી ટુ પ્લસ ટુ મંત્રી સ્તરની વાટાઘાટોમાં યુએસ પ્રતિનિધિમંડળનું નેતૃત્વ યુએસ સ્ટેટ સેક્રેટરી એન્ટોની બ્લિંકન અને યુએસ ડિફેન્સ સેક્રેટરી લોયડ ઓસ્ટિન કરી રહ્યા હતા. ભારતીય પ્રતિનિધિમંડળનું નેતૃત્વ વિદેશ મંત્રી એસ. જયશંકર અને સંરક્ષણ પ્રધાન રાજનાથ સિંહે કર્યું હતું.
તાજેતરમાં કેનેડાના પીએમ જસ્ટિન ટ્રુડોએ દાવો કર્યો હતો કે હરદીપ સિંહ નિજ્જરની હત્યામાં ભારતીય એજન્ટોનો હાથ હોઈ શકે છે. તેના જવાબમાં ભારતીય વિદેશ મંત્રાલયે કહ્યું કે આ તમામ આરોપો રાજકીય રીતે પ્રેરિત છે. આ પછી બંને દેશો વચ્ચે વિવાદ વધી ગયો.